Depuis les années 1940, le Père S. Dockx projetait de réaliser concrètement son idéal de toujours : donner à l'essor scientifique et religieux un " renouveau " par une "fraternisation intellectuelle entre le monde de la pensée moderne et celui de la tradition chrétienne".

C'est ainsi qu'en 1944, il élabora avec des amis le projet de créer un Institut qui serait constitué par l'ensemble des savants, philosophes des sciences et théologiens groupés en deux Académies, afin de collaborer, dans le cadre d'une institution permanente, à l'édification d'un corps de doctrine faisant la synthèse du savoir théorique moderne. Le but serait de favoriser les recherches de synthèse dans un monde scientifique orienté vers une spécialisation à outrance, mais surtout pour rendre possible un dialogue et une compréhension mutuelle entre les exigences de la raison et les aspirations qui la dépassent.

Dans son discours d'ouverture du 1^er Symposium de l'Institut, tenu au Palais des Académies à Bruxelles en 1947, le Père Dockx s'exprimait ainsi : "l'Institut est conçu comme une institution permanente groupant des professeurs de formation et de nationalités différentes, mais désireux de travailler à l'unification de la pensée " et, plus loin : "l'esprit qui devra présider aux travaux de l'Institut sera celui d'une large compréhension. Les points de vue pourront diverger, mais l'on s'efforcera de saisir la pensée des autres, non pour en souligner les déficiences, mais pour y découvrir les valeurs permanentes". Il rappela aussi l'évolution des sciences depuis Descartes et souligna la nécessité d'un effort de synthèse entre 'Science', 'Philosophie' et 'Théologie'. Cependant, disait-il, cette synthèse ne peut plus être le fait d'un penseur isolé, elle exige la collaboration ; d'autre part, les universités préoccupées, avant tout, de spécialisation, ne peuvent guère la favoriser. De là la nécessité de créer une institution consacrée spécifiquement à l'élaboration de cette synthèse.

L'institution ainsi élaborée prit le nom de INSTITUT INTERNATIONAL DES SCIENCES THEORIQUES. Il comporte deux classes distinctes : la classe des Sciences profanes (l'ACADEMIE INTERNATIONALE DE PHILOSOPHIE DES SCIENCES) et la classe des Sciences sacrées ( l'ACADEMIE INTERNATIONALE DES SCIENCES RELIGIEUSES).